Puskesmas Manutapen di diresmikan pada tanggal 12 November Tahun 2015 dan terletak di Jl.Pelajar Nomor 32 Kel Manutapen Kec Alak Kota Kupang. Puskesmas Manutapen sebelum di bentuk menjadi Puskesmas merupakan sebuah Puskesmas Pembantu pada Puskesmas Alak, yang dikarenakan beberapa pertimbangan seperti mendekatkan pelayanan pada masyarakat, luasnya wilayah pelayanan, serta besarnya jumlah masyarakat sehingga di naikan statusnya menjadi puskesmas.

Wilayah Kerja Puskesmas Manutapen yaitu Kelurahan Manutapen, Kelurahan Fatufeto, Kelurahan Mantasi.  dengan luas wilayah ± 2,03  Km², dengan Batas-batas wilayah antara lain sebagai berikut :

• Sebelah Utara    : Kelurahan Solor dan Bonipoi
• Sebelah Selatan : Kelurahan Penkase Oeleta
• Sebelah Barat    : Kelurahan Nunbaun Sabu dan Nunbaun Delha
• Sebelah Timur   : Kelurahan Airnona, Nunleu dan Fontein

Demografi

Berdasarkan data Badan Pusat Statistik untuk wilayah kerja Puskesmas Manutapen tahun 2016 tercatat jumlah penduduk Puskesmas Manutapen sebanyak  13.110 jiwa dengan 1838  Rumah Tangga. Angka Penduduk tertinggi terdapat di Kelurahan Manutapen dan Kelurahan Fatufeto (BPS Kota Kupang, 2016).

Rasio Jenis Kelamin

Dari 13.110 jiwa penduduk Puskesmas Manutapen , terdiri dari 6825 jiwa laki-laki, dan 6285 jiwa perempuan dengan Rasio jenis kelamin di Puskesmas Manutapen adalah jumlah laki-laki lebih banyak dibandingkan dengan jumlah kaum perempuan dengan sex ratio 109.